terça-feira, 22 de novembro de 2011
quinta-feira, 17 de novembro de 2011
experimentos evolucionários possíveis
Além das dificuldades químicas sobre a formação de ligações peptídicas, a estatística também joga contra. Um estudo mostrou que o número de experimentos para que uma enzima tenha uma funcionalidade idêntica à uma enzima atual seriam necessários 10^70 experimentos, enquanto que outro estudo mostra que na melhor das hipóteses, concluiu que o número de experimentos evolucionários possíveis em 4 bilhões de anos seria 10^43.
Existe uma discrepância de 10^27 unidades.
Estamos falando em uma enzima. Isto ainda parte de aminoácidos pré-formados, algus com estruturas bastante sofisticadas, como histidina, triptofano, tirosina, ou mesmo treonina, serina e cisteína, com grupos passíveis de sofrerem reações paralelas.
Não é a toa, que do ponto de vista químico, o surgimento da vida e das peças que compõem os processos vitais não pode ser confirmado usando apenas N2, H2O, CO2 e alguns outros gases e metais.
Existe uma discrepância de 10^27 unidades.
Estamos falando em uma enzima. Isto ainda parte de aminoácidos pré-formados, algus com estruturas bastante sofisticadas, como histidina, triptofano, tirosina, ou mesmo treonina, serina e cisteína, com grupos passíveis de sofrerem reações paralelas.
Não é a toa, que do ponto de vista químico, o surgimento da vida e das peças que compõem os processos vitais não pode ser confirmado usando apenas N2, H2O, CO2 e alguns outros gases e metais.
quarta-feira, 19 de outubro de 2011
quinta-feira, 6 de outubro de 2011
transcrição sem volta
sabe-se que a sequência de bases nucleicas codifica a estrutura primária de uma enzima- cada grupo de três nucleotídios significa a entrada de um aminoácido específico na enzima (tem o sinal de pare, codificada por duas sequências).
A transcrição é bastante complexa e requer a participação de enzimas que abrem a fita do DNA, para que seja montada uma fita de RNA mensageiro, que vai até o ribossomo, onde os aminoácidos ativados se ligam na sequência correta.
A teoria da evolução afira que as proteínas evoluem por tentativa e erro, contudo não existe uma volta para que a enzima "evoluída" seja retranscrita.
O único mecanismo previsto por esta teoria é a mutação randômica- não existe direcionamento. A teoria afirma que a evolução vem de um descendente comum, mas não explica o que este descendente comum deve ter : glicólise, DNA, RNA, ribossomos, membrana celular, wow !! É muita coisa. Pense bem !
Muita coisa para algo que seja mutação randômica.
A transcrição é bastante complexa e requer a participação de enzimas que abrem a fita do DNA, para que seja montada uma fita de RNA mensageiro, que vai até o ribossomo, onde os aminoácidos ativados se ligam na sequência correta.
A teoria da evolução afira que as proteínas evoluem por tentativa e erro, contudo não existe uma volta para que a enzima "evoluída" seja retranscrita.
O único mecanismo previsto por esta teoria é a mutação randômica- não existe direcionamento. A teoria afirma que a evolução vem de um descendente comum, mas não explica o que este descendente comum deve ter : glicólise, DNA, RNA, ribossomos, membrana celular, wow !! É muita coisa. Pense bem !
Muita coisa para algo que seja mutação randômica.
terça-feira, 19 de julho de 2011
probabilidades e enzimas
“The cytoplasm of E. coli contains about 15,000 ribosomes, thousands of copies each of about 1,000 different enzymes”
Lehninger, Biochemistry, 4 ed., pg. 6
Segundo os evolucionistas, o desenvolvimento de novas espécies se dá por mutações aleatórias, gerando novos indivíduos que se mostraria mais ou menos aptos, de acordo com o ambiente que induziria uma seleção natural.
Uma das bases da vida do ponto de vista químico é a catálise promovida pelas enzimas, a grande maioria delas formada por sequência de aminoácidos.
Tomando apenas uma enzima das 1000 enzimas de um ser unicelular como E. Coli, vamos calcular o número de enzimas possíveis com estrutura primária com 200 aminoácidos (e apenas com 200, sem calcular 199 nem 201) é de 20 exp 200, ou 1,6 . 10 exp 260.
Para começar, estima-se que o tempo de existência da terra seja de 4,5 bilhões de anos, ou 1,42. 10 exp17 segundos. Assim o tempo para selecionar cada aminoácido seria de 1,12.10 exp -243 segundos.
As reações mais rápidas (transferência de próton) são limitadas por difusão de reagentes, e ocorrem após 10 exp -6 segundos. Não existe tempo para que um aminoácido entre na estrutura, seja “provado”, desencaixado e entre outro aminoácido. Além disso, deveria haver o tempo para o desenvolvimento do ser com a enzima mutante, o seu teste para a seleção natural, sua reprodução vantajosa, e assim por diante por algumas gerações até que o novo gene fosse fixado. Apenas para a geração de uma enzima de 200 AA.
Além disso, sabemos que não são os aminoácidos que se combinam para formar novas enzimas, mas sim os nucleotídios do DNA, em que cada grupo de três nucleotídios codifica um aminoácido. São possíveis 64 combinações, sendo que três delas significam “PARE”. O que apenas aumenta o número de combinações possíveis, e aumenta o tempo necessário para que ocorra a mutação para formar a informação genética que codifica uma proteína.
A teoria da evolução será o novo geocentrismo para as gerações futuras de cientistas. Se você tem fé na evolução randômica, tudo bem. Mas do ponto de vista é algo que não pode ser testado, não pode ser provado, e que quando suas previsões foram contestadas por dados experimentais, surgiram rugidos pseudo-científicos. Os fundamentos do surgimento da vida a partir da matéria inanimada, bem como a teoria da evolução não passam por qualquer exame do ponto de vista de uma lógica química.
Lehninger, Biochemistry, 4 ed., pg. 6
Segundo os evolucionistas, o desenvolvimento de novas espécies se dá por mutações aleatórias, gerando novos indivíduos que se mostraria mais ou menos aptos, de acordo com o ambiente que induziria uma seleção natural.
Uma das bases da vida do ponto de vista químico é a catálise promovida pelas enzimas, a grande maioria delas formada por sequência de aminoácidos.
Tomando apenas uma enzima das 1000 enzimas de um ser unicelular como E. Coli, vamos calcular o número de enzimas possíveis com estrutura primária com 200 aminoácidos (e apenas com 200, sem calcular 199 nem 201) é de 20 exp 200, ou 1,6 . 10 exp 260.
Para começar, estima-se que o tempo de existência da terra seja de 4,5 bilhões de anos, ou 1,42. 10 exp17 segundos. Assim o tempo para selecionar cada aminoácido seria de 1,12.10 exp -243 segundos.
As reações mais rápidas (transferência de próton) são limitadas por difusão de reagentes, e ocorrem após 10 exp -6 segundos. Não existe tempo para que um aminoácido entre na estrutura, seja “provado”, desencaixado e entre outro aminoácido. Além disso, deveria haver o tempo para o desenvolvimento do ser com a enzima mutante, o seu teste para a seleção natural, sua reprodução vantajosa, e assim por diante por algumas gerações até que o novo gene fosse fixado. Apenas para a geração de uma enzima de 200 AA.
Além disso, sabemos que não são os aminoácidos que se combinam para formar novas enzimas, mas sim os nucleotídios do DNA, em que cada grupo de três nucleotídios codifica um aminoácido. São possíveis 64 combinações, sendo que três delas significam “PARE”. O que apenas aumenta o número de combinações possíveis, e aumenta o tempo necessário para que ocorra a mutação para formar a informação genética que codifica uma proteína.
A teoria da evolução será o novo geocentrismo para as gerações futuras de cientistas. Se você tem fé na evolução randômica, tudo bem. Mas do ponto de vista é algo que não pode ser testado, não pode ser provado, e que quando suas previsões foram contestadas por dados experimentais, surgiram rugidos pseudo-científicos. Os fundamentos do surgimento da vida a partir da matéria inanimada, bem como a teoria da evolução não passam por qualquer exame do ponto de vista de uma lógica química.
sexta-feira, 15 de julho de 2011
a bioquímica tem um objetivo
"Biology is the study of complicated things that give the appearance of having been designed for a purpose." escreve Richard Dawkins, autor de The Blind Watchmaker.
Esta afirmação não pode se aplicar quando se estuda um processo bioquímico de várias etapas, como a glicólise anaeróbica, o ciclo de Krebs (ácido cítrico), a cadeia respiratória, a fotossíntese, a síntese de aminoácidos, a síntese de peptídios, a síntese de ácidos graxos, a síntese de carboidratos, a síntese das bases nucleicas, entre outros processos, porque todas estas reações ocorrem em etapas, e o produto de uma reação é desenhado para ser o substrato de outra, e o gene que codifica uma proteína é inútil se não existir o gene que codifica a seguinte, e a seguinte, e a seguinte.
Porém, a história não termina por aqui, porque todos estes processos se comunicam uns com os outros. A alanina, um dos vinte aminoácidos proteinogênicos é produzido através da aminação redutiva do piruvato, um dos produtos da glicólise anaeróbica. O nitrogênio dos aminoácidos entra nos ciclos da vida através de enzimas com molibdênio no seu sítio ativo, e assim por diante.
Existem objetivos químicos, moléculas-alvo, sequências de reações, e pensar desta forma é que tem contribuído para o crescimento da ciência, enquanto que o pensamento da mudança aleatória não responde às necessidades da bioquímica, não importa quanto esperneiem os evolucionistas.
Esta afirmação não pode se aplicar quando se estuda um processo bioquímico de várias etapas, como a glicólise anaeróbica, o ciclo de Krebs (ácido cítrico), a cadeia respiratória, a fotossíntese, a síntese de aminoácidos, a síntese de peptídios, a síntese de ácidos graxos, a síntese de carboidratos, a síntese das bases nucleicas, entre outros processos, porque todas estas reações ocorrem em etapas, e o produto de uma reação é desenhado para ser o substrato de outra, e o gene que codifica uma proteína é inútil se não existir o gene que codifica a seguinte, e a seguinte, e a seguinte.
Porém, a história não termina por aqui, porque todos estes processos se comunicam uns com os outros. A alanina, um dos vinte aminoácidos proteinogênicos é produzido através da aminação redutiva do piruvato, um dos produtos da glicólise anaeróbica. O nitrogênio dos aminoácidos entra nos ciclos da vida através de enzimas com molibdênio no seu sítio ativo, e assim por diante.
Existem objetivos químicos, moléculas-alvo, sequências de reações, e pensar desta forma é que tem contribuído para o crescimento da ciência, enquanto que o pensamento da mudança aleatória não responde às necessidades da bioquímica, não importa quanto esperneiem os evolucionistas.
segunda-feira, 11 de julho de 2011
cadeias lineares
As cadeias carbônicas lineares (-CH2-CH2-) são importantes na formação das membranas celulares, e definem as fronteiras de um ser vivo. Ocorrem nos fosfolipídios com 16 e 18 átomos de carbono, principalmente. A pergunta é -seriam formadas em uma condição sem vida...
A energia de combustão de alcanos ramificados e lineares nos dá uma idéia. Primeiro alcanos lineares
Lower heating value for some organic compounds (at 15.4°C.
Fuel MJ/kg
Methane 50.009
Ethane 47.794
Propane 46.357
Butane 45.752
Pentane 45.357
Hexane 44.752
Heptane 44.566
Octane 44.427
Agora alcanos ramificados
Fuel MJ/kg
Isobutane 45.613
Isopentane 45.241
2-Methylpentane 44.682
2,3-Dimethylbutane 44.659
2,3-Dimethylpentane 44.496
2,2,4-Trimethylpentane 44.310
O valor do calor de combustão, que dá uma medida da energia liberada após transformação em CO2 e água para o iso-butano (metilpropano) é menor do que o butano, uma indicação da maior estabilidade deste composto, e assim, em qualquer equilíbrio, seria formado em maior quantidade. O mesmo vale para os outros alcanos ramificados.
Assim, alcanos lineares seriam os menores componentes de misturas obtidas em processos aleatórios de síntese de cadeias carbônicas. Ademais, os mecanismos de síntese das próprias cadeias carbônicas constitui um mistério.
A energia de combustão de alcanos ramificados e lineares nos dá uma idéia. Primeiro alcanos lineares
Lower heating value for some organic compounds (at 15.4°C.
Fuel MJ/kg
Methane 50.009
Ethane 47.794
Propane 46.357
Butane 45.752
Pentane 45.357
Hexane 44.752
Heptane 44.566
Octane 44.427
Agora alcanos ramificados
Fuel MJ/kg
Isobutane 45.613
Isopentane 45.241
2-Methylpentane 44.682
2,3-Dimethylbutane 44.659
2,3-Dimethylpentane 44.496
2,2,4-Trimethylpentane 44.310
O valor do calor de combustão, que dá uma medida da energia liberada após transformação em CO2 e água para o iso-butano (metilpropano) é menor do que o butano, uma indicação da maior estabilidade deste composto, e assim, em qualquer equilíbrio, seria formado em maior quantidade. O mesmo vale para os outros alcanos ramificados.
Assim, alcanos lineares seriam os menores componentes de misturas obtidas em processos aleatórios de síntese de cadeias carbônicas. Ademais, os mecanismos de síntese das próprias cadeias carbônicas constitui um mistério.
quinta-feira, 7 de julho de 2011
Questões sobre a geração abiótica de biomoléculas
Aminoácidos e Peptídios
A formação de peptídios a partir de aminoácidos demonstra alguns pontos importantes da química.
Os aminoácidos entre pH 2 a 10 estão na forma “zwitteriônica” ou de íon duplo, em que o grupo amina estão na forma amônio, e o grupo ácido carboxílico estão na forma carboxilato. Porém estas formas não são reativas, o grupo amônio não atua como nucleófilo e o grupo carboxilato não tem características eletrofílicas.
Na química biológica este problema não ocorre, porque o grupo COO- forma um éster com uma tira de RNA, que atua como grupo de saída. Porém isto não é tudo, porque existe a necessidade de especificidade na reação com os aminoácidos. Se misturarmos dois tipos diferentes de aminoácidos, por exemplo- glicina e alanina, teremos a possibilidade de formação de quatro produtos de dois aminoácidos Gli-Gli, Gli-Ala, Ala-Gli e Ala-Ala.Para três aminoácidos este número aumenta para oito.
São 20 os aminoácidos constituintes das células, e para dois aminoácidos este número sobe para 20¨2, ou seja 400. Para um peptídio de apenas dez aminoácidos, este número é de 10¨20 um número excessivamente alto para qualquer mecanismo aleatório de síntese de peptídios. Uma enzima chinelona tem 100 aminoácidos, e esse número chega a 20¨100, ou seja 1,27.10¨130. Estima-se que o número de átomos do universo seja 10¨80. Torna-se óbvio que mecanismos de tentativa e erro estão descartados para a sequência primária de uma enzima ativa qualquer.
Aminoácidos e Peptídios
A formação de peptídios a partir de aminoácidos demonstra alguns pontos importantes da química.
Os aminoácidos entre pH 2 a 10 estão na forma “zwitteriônica” ou de íon duplo, em que o grupo amina estão na forma amônio, e o grupo ácido carboxílico estão na forma carboxilato. Porém estas formas não são reativas, o grupo amônio não atua como nucleófilo e o grupo carboxilato não tem características eletrofílicas.
Na química biológica este problema não ocorre, porque o grupo COO- forma um éster com uma tira de RNA, que atua como grupo de saída. Porém isto não é tudo, porque existe a necessidade de especificidade na reação com os aminoácidos. Se misturarmos dois tipos diferentes de aminoácidos, por exemplo- glicina e alanina, teremos a possibilidade de formação de quatro produtos de dois aminoácidos Gli-Gli, Gli-Ala, Ala-Gli e Ala-Ala.Para três aminoácidos este número aumenta para oito.
São 20 os aminoácidos constituintes das células, e para dois aminoácidos este número sobe para 20¨2, ou seja 400. Para um peptídio de apenas dez aminoácidos, este número é de 10¨20 um número excessivamente alto para qualquer mecanismo aleatório de síntese de peptídios. Uma enzima chinelona tem 100 aminoácidos, e esse número chega a 20¨100, ou seja 1,27.10¨130. Estima-se que o número de átomos do universo seja 10¨80. Torna-se óbvio que mecanismos de tentativa e erro estão descartados para a sequência primária de uma enzima ativa qualquer.
quimica e evolução
quimica e evolução
A origem da vida é um dos pontos que a ciência apenas delineia alguns "deve ter sido assim", mas nada é claro. O surgimento de qualquer coisa que se pareça com vida envolve muitos processos químicos ocorrendo de forma simultânea.
A forma de raciocínio precede qualquer teoria evolucionista, e deve seguir as leis da termodinâmica, em que se formam os produtos mais estáveis.
Em uma atmosfera oxidativa são CO2 e H2O, condições que não permitem a formação e manutenção de cadeias carbônicas, que fazem parte de todas as moléculas orgânicas da vida.
A origem da vida é um dos pontos que a ciência apenas delineia alguns "deve ter sido assim", mas nada é claro. O surgimento de qualquer coisa que se pareça com vida envolve muitos processos químicos ocorrendo de forma simultânea.
A forma de raciocínio precede qualquer teoria evolucionista, e deve seguir as leis da termodinâmica, em que se formam os produtos mais estáveis.
Em uma atmosfera oxidativa são CO2 e H2O, condições que não permitem a formação e manutenção de cadeias carbônicas, que fazem parte de todas as moléculas orgânicas da vida.
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